辣椒自明末从美洲传入中国，最初只是作为观赏作物，而后才渐渐尝试食用，并在西南地区散播开来。到了清嘉庆以后，西南几省已经“种以为蔬”“无椒芥不下箸也，汤则多有之”“择其极辣者，且每饭每菜，非辣不可”。随着茶马古道贸易日益繁盛，物资交流日益频繁，种植和食用辣椒的传统也在200年前经茶马占道传入芒康，并逐渐在气候适宜种植辣椒的索多西、朱巴龙、曲孜卡、纳西、如美等地大而积种植。
芒康县同邻省云南德钦、四川巴塘两县接壤，自古以来就是西藏同内地贸易、交流的重要输送大动脉——茶马古道的重要物资集散地和中转站。芒康县人民种植辣椒、食用辣椒酱的历史也远早于西藏其他地方。在芒康的马帮文化中，味道鲜美、便于储存的索多西辣椒酱一直深受常年行走于崇山峻岭间的马帮商人的喜爱。茶马古道上源源不断的马帮为西藏这片神奇的土地输送来了广受当地农牧民群众喜爱的辣椒，经芒康人民智慧的头脑和勤劳双手的加工，制作出具有浓郁藏区特色的辣椒酱。
索多西地处金沙江河谷地带，耕地严重不足，导致藏区农牧民主要食品——青稞产量直不高，当地人的生活也异常艰难，常常食不果腹。一位当地的喇嘛有感索多西当地人民民生多艰，心怀怜悯，便外出寻访，为百姓谋划生计。通过茶马古道上的马帮，喇嘛获得了一些农作物的种子，并从云贵等地进藏经商的商人处学习了种植技术，学成返回索多西后，经过反复试种，做为新鲜事物的辣椒非常适应当地，试种当年就获得了丰收，种出的辣椒色泽鲜红，肉质饱满娇嫩，口感辣而不燥，很快就被芒康附近的百姓所接受，并经茶马古道销往内地，索多西辣椒的名声也逐渐传播开来。
由于当地马帮众多，在漫长的行商途中，辣椒也不易长时间存放，索多西人大约在民国时期从内地学习了制作辣椒酱的技术，一方面方便马帮商人随身携带，另方面也丰富了辣椒的吃法。索多西辣椒酱在发展演化的过程中，也经历了从群众自制到家庭小作坊再到企业规模化生产的历史过程。
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